Fin Rot:Una delle malattie più predominanti. Ciò si è verificato tra i pesci di peso corporeo superiore a 1 kg. I pesci di peso inferiore a 1 kg erano meno vulnerabili ma non esenti da questa malattia. La putrefazione delle pinne era più predominante nella pinna caudale, sebbene occasionalmente fossero colpite anche le pinne pettorali e pelviche, sebbene i pesci morissero raramente. Nelle parti appena infette appare una striscia bianca vicino alla pinna caudale16 che si allarga in seguito quando il muscolo e i raggi iniziano a degenerare lentamente.
Generalmente, tali pinne colpite possono guarire e rigenerarsi.
Epatoma:questo è stato generalmente osservato nei pesci di peso superiore a 1 kg. Questa è una malattia cancerosa trovata nel fegato. Circa il 30% dei pesci esaminati presentava la malattia dell'epatoma. Questo è stato segnalato anche dalla stazione di ricerca sulla pesca di Trishuli. Il fegato infetto diventa ingrossato e diventa bianco pallido. I pesci gravemente infetti perdono l'equilibrio. Questa malattia è causata dalla contaminazione del mangime con aflotossina prodotta da muffe, Aspergillus flavus. L'epatoma insorge dopo 4-6 mesi di esposizione18. Una dose da 0,1 a 0,5 ppb di aflatossina-B1 nei mangimi può causare il cancro al fegato.
Il fungo è principalmente un problema nelle uova fecondate durante l'incubazione, e nel pesce dopo la deposizione delle uova. Ciò potrebbe essere dovuto a lividi causati dalla manipolazione. Negli avannotti cresciuti le malattie fungine sono state appena osservate in quanto non sono soggetti a stressanti manipolazioni. Il fungo più importante è Saprolegnia sp.
Questo appare come "cotone" e si diffonde rapidamente per coprire tutto il corpo, inizialmente attaccando ferite aperte nei pesci adulti16. Casi gravi possono uccidere il pesce infestato.
Durante il periodo di studio sono stati osservati alcuni disturbi intestinali. L'evento più comune erano le carcasse con lo stomaco gonfio. Spesso in tali campioni sono state osservate un'emorragia e la presenza di liquido acquoso nello stomaco. In tali casi lo stomaco era completamente vuoto indicando che il pesce non aveva consumato alcun mangime per diversi giorni prima della morte. Lo stomaco gonfio era anche associato al rossore dell'apertura anale. Tali campioni spesso scaricavano fluido giallo scuro se premuti delicatamente all'estremità prossima dell'apertura.
• Muso smussato:alcuni individui avevano un muso smussato o asimmetrico. Sembrava che la mascella inferiore crescesse normalmente, ma la mascella superiore rimanesse sottosviluppata durante il corso della crescita e dello sviluppo.
• Avanelli attorcigliati:Nel 1992 si sono verificati alcuni anormali attorcigliamenti negli avannotti sottosviluppati. Questi furono separati da quelli sani ma non sopravvissero a lungo.
• Branchie anormali:le branchie anormali erano frangiate e non sviluppate adeguatamente. Tali branchie mancavano di compattezza e arrossamento in apparenza.
• Opercolo degenerato:in alcuni avannotti mancava la parte posteriore dell'opercolo e le lamelle non erano completamente ricoperte dall'opercolo. Le ragioni dell'opercolo degenerato non erano note.
• Cecità:a volte uno degli occhi era assente per ragioni sconosciute. All'inizio gli occhi perduti erano opachi ma alla fine portarono alla completa degenerazione. Tali pesci sono stati trovati a perdere il loro equilibrio.
Le trote sono delicate e richiedono acque molto ossigenate 7, 8.