L'identificazione è importante per la tenuta dei registri e la protezione contro i furti. I sistemi di identificazione a microchip sono comunemente usati. al portello, i microchip vengono inseriti nel muscolo piping appena dietro la testa con una pistola per impianto e un ago.
Il codice nel microchip viene letto da un dispositivo chiamato lettore di microchip, che costa $ 1, da 000 a $ 1, 250. Ogni marca di microchip richiede il proprio lettore. I chip costano circa $ 8,50 ciascuno e sono disponibili in confezioni da 50. Fasce per le gambe numerate, disponibile in vari colori, sono utilizzati per l'identificazione e di solito sono posizionati intorno alla caviglia. Anche il tatuaggio come mezzo di identificazione permanente è stato utilizzato con successo, ma richiede una certa abilità.
Il periodo di incubazione per le uova di emu va da 46 a 56 giorni con una media di 50 giorni. La durata dell'incubazione è fortemente influenzata dalla temperatura. Temperature ottimali, da 96,5 a 97,5 gradi F, dovrebbe comportare un'incubazione di 49-52 giorni. Le impostazioni di umidità dovrebbero variare dal 24 al 35 percento. Incubazione riuscita delle uova in verticale, è stata segnalata la posizione della cella d'aria in alto o orizzontale. Gira le uova da quattro a sei volte al giorno. Come nello struzzo, la perdita di peso delle uova è importante e il 15% è l'ideale.
Sono essenziali un sistema settimanale di pesatura delle uova e una buona tenuta dei registri. Le uova di emu sono opache, quindi un metodo chiamato tapping ha sostituito la procedura di speratura. Toccando l'uovo con una piccola bacchetta cilindrica di metallo si producono suoni particolari che possono essere utilizzati per identificare un uovo che è stato schiacciato internamente e deve essere spostato nella schiusa.
Le temperature dell'incubatrice sono generalmente le stesse nell'incubatrice o un grado in meno. La percentuale di schiudibilità nei pulcini di emu è stata segnalata tra il 50 e l'80 percento. È importante tenere buoni registri perché problemi specifici con la schiudibilità sono spesso associati alla morte embrionale in vari punti dell'incubazione. I problemi comuni includono uova sterili, infezione batterica delle uova e malposizionamento.