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PGPR:agente biologico per le malattie trasmesse dal suolo

Bisogno di PRPG

Le perdite di raccolto in tutto il mondo sono in gran parte causate da malattie trasmesse dal suolo. La produttività globale delle colture è influenzata negativamente da malattie causate da agenti patogeni delle piante, con conseguenti perdite di resa del 20-40 per cento in varie colture di cereali e legumi ogni anno.

Nel corso della stagione agricola 2016-17, 57, In India sono state utilizzate 000 tonnellate di pesticidi sintetici per proteggersi dai patogeni delle piante e dagli insetti nocivi. Però, i biopesticidi rappresentavano solo 6340 tonnellate metriche.

Simile a resistenza agli erbicidi delle infestanti , molti organismi resistenti ai pesticidi sono emersi a causa del continuo uso di pesticidi nell'agricoltura moderna e della presenza di residui di pesticidi negli ortaggi, cereali, e cereali rappresentano anche grandi pericoli per la salute umana.

i pesticidi utilizzati per combattere le malattie delle piante colpiscono l'insetto benefico naturale, fertilità del suolo e microbiota del suolo negativamente Khatoon et al., 2020

Ulteriore, pesticidi chimici e fertilizzanti utilizzati in modo non regolamentato e indiscriminato causano inquinamento del suolo, acqua, e aria, nonché una diminuzione della fauna e della microflora del suolo. Per controllare le malattie trasmesse dal suolo in tutto il mondo, grandi quantità di denaro vengono spese per pesticidi sintetici. A causa degli effetti dannosi delle sostanze chimiche di sintesi sull'ambiente, approcci alternativi al controllo delle malattie delle piante vengono esplorati sempre di più.

anche l'acidità del suolo dovuta a queste forti sostanze chimiche è alterata

Slepetiene et al., 2020

*A deve leggere :Tipi di suoli

Le attività antropiche possono causare danni ecologici e scoraggiare la salute del suolo, in ultima analisi, l'esaurimento del patrimonio non rinnovabile. È quindi essenziale adottare diverse modalità rispettose dell'ambiente. Nella presente circostanza, l'agricoltura sostenibile è essenziale in quanto offre la capacità di soddisfare non solo i nostri bisogni attuali, ma anche di garantire un futuro sano, qualcosa che non può essere realizzato attraverso le pratiche agricole dannose convenzionali Santoyo et al., 2017

Al fine di ridurre l'uso di pesticidi per la produzione agricola, i microrganismi benefici della rizosfera possono essere sfruttati per soluzioni di agricoltura sostenibile. Rispetto ai tradizionali pesticidi chimici/di sintesi, i biopesticidi offrono numerosi vantaggi, compreso il 100% di biodegradabilità e solubilità in acqua.

I prodotti biochimici e i microrganismi di origine vegetale sono quindi un'alternativa più sicura per il controllo delle malattie delle piante in agricoltura.


Cos'è PGPR?

I rizobatteri promotori della crescita delle piante a vita libera (PGPR) colonizzano le radici e il terreno che circonda le piante, promuovendone la crescita, sviluppo, e salute.

Un PGPR può anche essere classificato come agente di biocontrollo, un biofertilizzante, o un biopesticida, a seconda delle sue attività/capacità.

I rizobatteri che promuovono la crescita delle piante (PGPR) sono attori fondamentali in agricoltura Etesami e Maheshwari, 2018

*A deve leggere :Guida ai biofertilizzanti

Il PGPR esercita i suoi effetti benefici attraverso la capacità di controllare o prevenire la diffusione di organismi deleteri che hanno un impatto negativo sulla salute e sulla crescita delle piante.

Aiuta il benessere delle colture fissando l'azoto, fosfato solubilizzante, riduzione dei metalli pesanti, produzione di fitormoni (come auxina, gibberelline, citochinine ecc.), mineralizzazione della sostanza organica del suolo, residui colturali in decomposizione, sopprimere i fitopatogeni, ecc. He et al., 2019

Il biocontrollo dei patogeni viene effettuato da PGPR in alcuni dei seguenti modi:

1. Alcuni batteri possono colonizzare una nicchia vegetale in modo più rapido ed efficace rispetto ai patogeni che causano malattie. Ciò a sua volta si traduce in una bassa disponibilità di nutrienti per gli organismi deleteri poiché i batteri benefici competono per i nutrienti.

2. Per di più, alcuni batteri producono antibiotici. Questi anticorpi sono composti organici letali per gli organismi che causano malattie a basse concentrazioni.

3. Infine, il batterio induce un meccanismo di resistenza nelle piante chiamato Resistenza sistemica indotta (IRS) . Questo innesca la produzione di metaboliti di difesa aumentando la capacità difensiva della pianta.


Vantaggi di PGPR

Ci sono alcuni vantaggi nell'usare il PGPR come agente di biocontrollo rispetto ai composti di controllo chimico.

I PGPR sono utili, microrganismi presenti in natura. Sono inoltre atossici e sicuri da usare. Per di più, dal punto di vista ecologico, sono sostenibili (a lungo termine).

Per di più, I PGPR possiedono una vasta gamma di modalità di azione, compresa l'antibiotico, siderofori, enzimi che degradano le pareti cellulari, bio-tensioattivi, e volatili, così come la resistenza sistemica nelle piante.


PGPR contro gli stress abiotici e biotici delle piante

Ci sono vari tipi di stress sulla pianta. Queste sollecitazioni possono essere classificate in generale in due tipi: Stress abiotici e biotici.


STRESS ABIOTICI

Lo stress abiotico può essere dettato da qualsiasi condizione ambientale sfavorevole che influisca sulla diversità dei microbi e modifichi anche le proprietà fisico-chimiche del suolo.

Come parte dello stress abiotico, ci sono numerose condizioni che hanno impatti negativi sul microbioma della pianta e sull'ecologia circostante, come la tossicità da metalli pesanti, salinità, siccità, e inondazioni.

  • Metalli pesanti

Quando metalli nocivi come il mercurio, amianto, cadmio, e aggregato di piombo nel suolo, causano stress alle piante e riducono gravemente la produttività delle colture. Oltre a influenzare negativamente il pH e la consistenza del suolo, l'aggregazione dei metalli influenza direttamente alcuni processi biologici nel suolo, compromettendo la crescita delle colture.

La presenza di metalli nella rizosfera ritarda la crescita delle piante interferendo con l'assorbimento dei nutrienti.

Sebbene il PGPR aumenti la crescita e la produttività delle piante, regola anche i contaminanti metallici del suolo attraverso vari meccanismi e migliora le proprietà del suolo.

Il problema può essere affrontato inoculando PGPR con resistenza metallica. Le piante possono essere efficacemente protette dallo stress abiotico da PGPR mediante l'induzione di Indotto Tolleranza Sistemica (IST).

UN siderofori è un metabolita microbico che forma complessi metallici in tracce. Questi sono composti a basso peso molecolare che hanno buone affinità con il ferro. I microbi li producono quando il ferro è carente nel terreno. Lo stress metallico è efficacemente contrastato dai siderofori prodotti dai microbi.

Biotensioattivi che sono composti anfifilici si trovano principalmente sulla superficie dei microrganismi. Migliorano la tolleranza ai metalli in tracce e aiutano a rimuovere il metallo del suolo.

Acidi organici a basso peso molecolare come acido ossalico e acidi citrici sono prodotti da PGPR. Questi acidi organici riducono lo stress da metalli in agricoltura. PGPR produce acidi inorganici che potrebbe prevenire lo stress del metallo attraverso la precipitazione.

Sostanze polimeriche extracellulari (EPS) sono polimeri microbici omo- o etero-polisaccaridi ad alto peso molecolare. I batteri rizosferici rilasciano polisaccaridi extracellulari come lipopolisaccaridi, polisaccaridi, peptidi solubili, e glicoproteina e creano un'area di restrizione degli anioni che aiuta nella rimozione o nella disintossicazione dei metalli pesanti attraverso il bioassorbimento.

La tabella seguente mostra il biorisanamento PGPR dei metalli pesanti nel suolo:

PGPR Pianta Metallo(i) Condizione di coltivazione Ruolo di PGPR Riferimenti
Brevundimonas
minuto,
Alcaligenes faecalis
Scripus
Mucronato
Mercurio casa verde • Aumento della fitodepurazione
• Diminuzione della tossicità del suolo
Mishra et al., 2016
Bacillo,
Stafilococco,
Aerococco
Prosopis juliflora,
Lolium mltiforum
Cromo
Cadmio,
Rame, Condurre
e Zinco
Condizioni della serra • Migliorare l'efficienza di
Fitodepurazione
• Tollera alte concentrazioni. di
• Cromo.
Wani e Khan, 2012
Rhizobium sp.,
Microbatterio sp.
Pisum sativum Cromo
(VI)
Condizioni della serra • Migliorare la concentrazione di
azoto nelle piante
• Diminuzione della tossicità del cromo
Mishra et al., 2016
Bacillo
megaterio
Brassica napus Condurre In condizioni di campo • Diminuzione dell'inquinamento del suolo
• Resa totale di sostanza secca delle piante
Reichmann, 2014
bradirizobio
japonicum
CB1809
Helianthus annuus
e Triticum
stima
Arsenico studi di pentola • Eccesso di biomassa vegetale
• Crescita in condizioni di alta
concentrazione di arsenico
Yavar et al., 2014
Mesorhizobium huakuii
subsp.
rengei B3
Pomodoro
Astragalus sinicus
Cadmio Idroponica • Espressione del gene PCSAt
maggiore capacità delle cellule di legarsi
Cd2
Sriprang et al., 2003
Bacillus subtilis SJ-101 Brassica juncea Nichel Esperimenti in vaso in crescita
Camera
• Facilitato l'accumulo di
Nichel.
Zaidi et al., 2006
Azotobacter chroococcum
HKN-5, Bacillus megaterium
HKP-1, B. mucillaginoso
HKK-1
Brassica juncea Condurre, zinco Esperimenti di pentole in
serra
• Crescita delle piante stimolata
• Pianta protetta dalla tossicità dei metalli
Wu et al., 2006
  • salinità

È dannoso per l'agroeconomia avere condizioni di salinità. Come risultato dell'uso agrochimico a lungo termine, i sali si accumulano nel terreno nel tempo, che porta a problemi di salinità.

Sotto stress da salinità, specie reattive dell'ossigeno (ROS) Compreso O-2, O2, e H2O2 danneggiare la cellula, che è noto come stress ossidativo. Un PGPR in grado di produrre componenti sia enzimatici che non enzimatici aiuta la pianta a sopravvivere allo stress salino. Gestendo il livello di H2O2, un sistema antiossidante enzimatico e non enzimatico neutralizza tale tossicità. I livelli di ROS sono regolarmente controllati da enzimi come catalasi e ascorbato perossidasi e componenti non enzimatici come l'ascorbato.

Prodotti PGPR ACC (1-amminociclopropan-1-carbossilato) deaminasi, che protegge le piante da stress da etilene.

  • Siccità

Un fattore importante che ostacola la produttività agricola in tutto il mondo è la siccità. La resistenza alla siccità si riferisce alla capacità di una pianta di persistere e resistere durante una siccità.

Modificando l'architettura della radice causata dai batteri, l'area totale della radice aumenta , con conseguente miglioramento dell'assorbimento di nutrienti e acqua, che facilita la crescita complessiva. Il batterio aumenta il numero di radichette di diametro minore con maggiore profondità, aumentando così la superficie totale dell'apparato radicale.

Con l'inoculazione riuscita di ceppi PGPR, la produttività delle colture può essere migliorata da mantenere una crescita dei germogli quasi media durante lo stress da siccità. Poiché riduce la superficie fogliare accessibile e la perdita di acqua per evaporazione è ridotta .

Lo stato idrico dell'impianto può essere determinato misurando il contenuto di acqua relativo (RWC) . Le piante trattate con PGPR hanno avuto una migliore gestione della RWC rispetto alle piante non trattate con PGPR. PGPR può regolare la chiusura stomatica di un impianto in aree aride e portare a un migliore RWC di un impianto.

Nelle piante, la modificazione osmotica è una delle principali strategie di adattamento per affrontare lo stress da siccità. Nelle piante che soffrono di stress da siccità, la prolina è un osmolita importante. Le piante con livelli di prolina più elevati sono più resistenti alla siccità. I livelli di prolina possono essere aumentati mediante inoculazione di PGPR.

La crescita e lo sviluppo delle piante sono facilitati da regolatori di crescita chimici e fitormoni come citochinine, acido abscissico, gibberelline, auxine, acidi jasmonici (JAs) e etilene . PGPR promuove lo sviluppo delle piante stressate dalla siccità regolando i fitormoni e i regolatori di crescita.

  • Alluvione

Durante un'alluvione, lo scambio di gas nell'apparato radicale si riduce> questo si traduce nell'accumulo di etilene. L'etilene è responsabile della regolazione dei tratti tolleranti alle inondazioni delle piante. Livelli elevati di ACC causano livelli inferiori di ossigeno nel sistema radicale durante un'alluvione.

L'elevata concentrazione di ACC accumulata nelle radici è ridotta dall'ACC deaminasi, che consente all'ACC di diffondersi fuori dalle radici. Questo meccanismo riduce i livelli di etilene durante e dopo l'allagamento.


STRESS BIOTICI

Nelle piante, lo stress biotico è causato da organismi viventi, come batteri, virus, fungo, insetti, e nematodi. Questi organismi interferiscono con i nutrienti dell'ospite, con conseguente morte delle piante. Lo stress biotico contribuisce alle perdite sia prima che dopo la raccolta.

Sebbene pochi microbi partecipino al controllo biologico dei patogeni, tuttavia è noto che il PGPR crea protezione da molte malattie seguendo vari meccanismi tra cui batteriocina, antibiotico, produzione di composti organici volatili (VOC), e lisi attraverso l'enzima extracellulareHamid et al., 2021

  • batteriocina

Tossine batteriche contro i batteri alias batteriocine sono secrezioni peptidiche con attività antimicrobica limitata. Le batteriocine sono prodotte sia da Gram-negativi (ad esempio, colicina ) e batteri Gram-positivi (ad esempio, nisina ). In condizioni di laboratorio, le batteriocine hanno dimostrato di essere utili nella lotta contro la malattia batterica del pomodoro.

  • Antibiosi

A causa del loro antimicrobico, insetticida, antivirale, fitotossico, citotossico, e proprietà antielmintiche, Gli antibiotici PGPR sono più potenti di altri. Una vasta gamma di sostanze antimicotiche è prodotta da Pseudomonas, di cui 2, 4 diacetilfloroglucinolo (2, 4-DAPG), butirrolattoni, ramnolipidi, N-butilbenzene sulfonammide.

  • Produzione COV

Esistono numerosi composti organici volatili (VOC) secreti dal PGPR che sono specialisti del biocontrollo per alcuni nematodi e microrganismi. I COV includono benzene, cicloesano, tetradecano, e 2-(benzilossi)-1-etanammina. L'HCN è uno dei VOC (forniti da microbi rizosferici) in grado di controllare alcuni fitopatogeni.

  • Lisi tramite Enzima Extracellulare

PGPR produce composti litici che consentono alle piante di combattere i microbi che causano infezioni. I rizobatteri producono enzimi extracellulari (chitinasi e β-1, 3-glucanasi) che sono legati alla lisi della parete cellulare. Chitinasi e -1, 3-glucanasi sono forti composti antimicotici sulle cellule fungine con le loro pareti fatte di chitina e β-1, 4-N-acetil-glucosamina.


Relazione simbiotica di PGPR e piante

Si propone che un'interazione metabolica tra piante e microbi coinvolga gli amminoacidi, zuccheri, acidi organici, e altre fonti di carbonio fornite dalle piante.

Le associazioni metaboliche tra piante e rizomicrobi possono essere esplorate in questa nicchia.

I metaboliti biologici dei microrganismi rizosferici sono cruciali per il successo ecologico. Secondo i loro modelli di assorbimento del substrato, i rizomicrobi in questo habitat svolgono un importante ruolo ecologico.

Molti ceppi di rizobatteri funzionano in modo da espellere un nuovo metabolita che non si trova nel sistema radicale nativo. Quindi complimentarmi con il sistema di root.

Aggiungendo abbondanti quantità di zucchero, i microbi del suolo proliferano rapidamente, dando l'impressione che il carbonio nel suolo sia in una capacità limitata nel suolo. Così, si attribuisce che le piante contengano ampi livelli di carbonio che si diffondono all'esterno attraverso molteplici vie metaboliche.

Sebbene le piante fissino il carbonio principalmente attraverso la respirazione, la deposizione rizosferica rilascia anche carbonio.

I rizobatteri producono metaboliti per le piante, ma i rizodepositi nelle piante producono una gamma di metaboliti che offrono enormi opportunità sia per attrarre che per inibire specifici ceppi batterici.

I rizomicrobi forniscono azoto, fosforo, e ferro alle piante in forme utilizzabili che sono essenziali per la crescita delle piante.

I rizomicrobi producono fitormoni come l'ACC deaminasi, citochinina, e acido indolo-3-acetico che sono essenziali per la crescita e lo sviluppo delle piante.


Criteri di selezione del PGPR

Per lo sviluppo di una formulazione PGPR di successo, le specie di rizobatteri dovrebbero possedere le seguenti caratteristiche Jeyarajan e Nakkeeran, 2000

  • Migliora la crescita delle piante
  • La moltiplicazione su scala di massa dovrebbe essere possibile
  • Deve possedere un'elevata competenza rizosferica
  • Dimostrare un'elevata capacità saprofitica competitiva
  • Dimostrare una gamma più ampia di attività
  • Compatibilità ecologica con altri rizobatteri
  • Resiliente alle condizioni di stress abiotico (termico, radiazione, essiccanti e ossidanti)
  • Dovrebbe essere rispettoso dell'ambiente


PGPR come biofertilizzante

I biofertilizzanti sono formulazioni vive di microbi benefici che aiutano a rendere disponibili i nutrienti alle piante. Attraverso la sua attività biologica, migliora la salute del suolo e quindi la microflora del suolo.

Il PGPR è un biofertilizzante?
Sì. PGPR è un fertilizzante biologico .

I PGPM sono il componente principale di questo biofertilizzante. Il PGPM può essere classificato in tre grandi gruppi, vale a dire, organismi micorrizici arbuscolari (AMF), sviluppo della pianta che avanza rizobatteri (PGPR), e rizobia azotofissatrice.

PGPR è stato utilizzato in tutto il mondo come biofertilizzante, aumento delle rese e della qualità del suolo. Con PGPR probabile che venga commesso, potrebbe portare alla sostenibilità agroalimentare .

Questi biofertilizzanti sono disponibili in forma solida e liquida, con formulazioni liquide risultate più efficaci. Inoculazione della radice, inoculazione di semi, e l'inoculazione del suolo sono i tre tipi principali di formulazioni liquide.

Dopo aver applicato il biofertilizzante Burkholderia phytofirmans alla radice di loietto, seme, e suolo, metodo di inoculazione del suolo era più efficiente nel migliorare la produzione di biomassa vegetale, fitorisanamento e degradazione degli idrocarburi Afzal et al., 2013


Vincoli di PGPR

  1. I PGPR hanno una proprietà di variazione naturale che ne limita l'uso. In condizioni di campo (al contrario delle condizioni di laboratorio controllate), è difficile prevedere come si comporterà un organismo.
  2. Inoltre, I PGPR sono microrganismi viventi, quindi avere la capacità di propagarli artificialmente sul campo è un'altra sfida.
  3. Anche la produzione di massa in modo ottimizzato è una sfida. Per di più, mantenendo la loro durata ed efficienza dell'attività biologica fino a quando anche l'applicazione sul campo non è complicata.
  4. I batteri PGPR non sono in grado di vivere a lungo nel suolo, e nel tempo i coltivatori dovranno reinoculare per mantenere la loro popolazione nel campo.


Esempi di PGPR

Qual è l'esempio PGPR?

Di seguito sono riportati alcuni degli esempi di PGPR e dei loro ruoli nella rizosfera:

Rappresentante
specie
Ruolo Meccanismo(i) coinvolto(i) Impianto(i) partecipante(i) Riferimenti)
Agrobatterio
radiobatterio
Migliora la bioprotezione Antibiotici - Mohanram e Kumar, 2019
Azotobatteri
chroococcum
Assiste in
biostimolazione
Produzione di gibberellina Cereali Zhang et al., 2019
Aiuta nella bioprotezione sideroforo -
Azospirillum brasilense Biofertilizzazione solubilizzazione dei fosfati Mais (Zea mays), Grano (Triticum
aestivum L.) e Riso (Oryza sativa)
Lucia et al., 2004
Bacillus cereus Aumenta la bioprotezione lipopeptidi Fagiolo (Phaseolus vulgaris) Ongena e Jacques, 2008;
Vaikundamoorthy et al., 2018;
Hashami et al., 2019
Sistemico indotto e acquisito
resistenza
Pomodoro (S. lycopersicum)

Soia (Glycine Max L.)
Biorimedio Produzione di amilasi
Bonifica rifiuti industriali
-
-
Bacillus subtilis Biofertilizzazione Sintesi dell'ammoniaca Mais (Zea mays) Ouhaibi-Ben Abdeljalil et al.,
2016; Ait-Kaki et al., 2014;
Tahir et al., 2017
Aiuta nella biostimolazione Attraverso la produzione di IAA e citochinine Cece (Cicer arietinum)
Pomodoro (S. lycopersicum L.)
Bioprotezione lipopeptidi -
Produzione di catalasi Cetriolo (Cucumis sativus)
Biorimedio Xenobiotici degradanti e
allelochimici
-
Enterobacter oryzae Biofertilizzazione Fissazione dell'azoto Mangart e Marmellata (Acacia acuminata) Dinnage et al., 2019
Frankia casuarinae, F.
inefficace, F. irregolare,
e F. saprophytica
Biostimolazione Produzione di citochinine - Nouioui et al., 2019
Polmonite da Klebsiella Aiuta la biofertilizzazione Fissazione dell'azoto Mais (Zea mays) Kuan et al., 2016; Sharma
et al., 2019
Bioprotezione Sistemico acquisito e indotto
resistenza
Arachidi (Arachis hypogaea)
Mesorhizobium loti Biofertilizzazione Fissazione dell'azoto Loto (Arabidopsis thaliana) Kaneko et al., 2000
Metilobatterio
exotorquens
Aiuta la biostimolazione Produzione di citochinine Arabidosi, orzo, mais e soia Kaneko et al., 2000
Paenibacillus
xylanexedens
Facilita la bioprotezione Produzione di chitinasi Frumento (Triticum aestivum L.) Verma et al., 2016
Pseudomonas
aeruginosa
Aiuta nella biofertilizzazione solubilizzazione dei fosfati Mais (Zea mays) Hameeda et al., 2008;
Ahemad e Khan, 2012;
Paramanandham et al., 2017;
Cheng et al., 2019; Lawrance
et al., 2019
Aiuta nella bioprotezione Produzione di ammoniaca Senape campestre (Brassica campestris L.)
Produzione di acido cianidrico Erba dell'elefante (Pennisetum
purpureo)
Assiste in
Biorimedio
Produzione di cellulasi Riso (O. sativa), Pisello (P. sativa)
Assorbimento di metalli pesanti amaranto, Pomodoro (solanum
lycopersicum L.)
rizobio
leguminosarum
Biostimolazione Produzione di gibberelline Riso (O. sativa L.) Yanni et al., 2001
Serratia marcescens Bioprotezione produzione di sideroforo, chitinasi e
proteasi
Zucca di campo (Poa pratensis) Selvakumar et al., 2008;
Rathore e Gupta, 2015
Stafilococco
saprofita
Biostimolazione Produzione di IAA Specie ornamentali Manzoor et al., 2019
Stenotrophomonas
rizofila
Bioprotezione Sintesi dell'amilasi Mais (Zea mays) e Canola (Brassica
napus)
Ghavami et al., 2017

Tecnologia agricola

Agricoltura moderna
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