Se sono necessari un laboratorio di produzione di alghe e serbatoi, un'area separata dovrebbe essere costruita a questo scopo all'interno o adiacente all'incubatoio. In genere, quando l'incubatoio produce le proprie alghe, una stanza in quarantena viene utilizzata per la produzione di colture su scala di laboratorio fino a volumi di 10-20 litri. Sono necessarie strutture per sterilizzare l'acqua e trasferire igienicamente gli stock di alghe. Grandi volumi di alghe di 500-5 000 litri, in serbatoi o grandi sacchetti di plastica, vengono coltivate in un'area dedicata all'interno o all'esterno.
Però, negli ultimi anni, microalghe coltivate commercialmente, che vengono poi concentrati per la vendita, spesso può essere più conveniente per un'azienda rispetto alla crescita in proprio, quando la costruzione, si tiene conto dei costi operativi e del personale.
T ecco due metodi principali per produrre rotiferi da utilizzare come mangime per le larve:
I sistemi di produzione di rotiferi ad alta densità possono ridurre drasticamente il numero di serbatoi di produzione di rotiferi necessari per un incubatoio. Un esempio di un sistema di produzione di rotiferi ad alta densità, progettato per produrre rotiferi per la produzione di larve di pesce presso il Darwin Aquaculture Center (DAC), Territori del Nord, Australia, che è stato anche adattato per produrre rotiferi per la produzione di granchi di fango in Micronesia.
Un sistema di schiusa di Artemia dimensionato per soddisfare la domanda dell'impianto di allevamento di larve di granchio del fango al picco della domanda dovrebbe essere installato nelle immediate vicinanze dell'area di allevamento delle larve per ridurre al minimo il lavoro dei tecnici nel trasferimento del mangime al bestiame. I sistemi e i metodi di schiusa dell'artemia sono dettagliati in numerose pubblicazioni.